کلیسای سورپ سرگیس یکی دیگر از کلیساهای استان آذربایجان غربی است که در قسمت شمال غربی شهرستان خوی و در محله قدیمی امامزاده واقع شده است. با توجه به تحقیقاتی که به عمل آمده زمان ساختمان کلیسا را به دوره های متفاوت یعنی قرون چهارم و نهم میلادی نسبت می‌دهند که در تاریخ زندگانی سرگیس مقدس نیز ۳۷۸ میلادی قید شده است.
نمای خارجی کلیسای سورپ سرگیس مکعب مستطیل و پلان آن به صورت مستطیل به طول و عرض ۳۲ در ۱۸ و ارتفاع آن ۶ متر است. در داخل کلیسا شش عدد ستون سنگی با پلان های صلیبی وجود دارد. در انتهای ضلع شرقی، محراب کلیسا که دو اتاق کوچک در طرفین آن قرار دارد، واقع شده است.
پلان کلیسای سورپ سرگیس تحت تاثیر پلان های معابد ایرانی بوده و دارای دو ورودی از سمت جنوب و غرب است. چهار زوج روزنه کوچک در ضلع جنوب و شمال، سه روزنه در شرق و یک روزنه در ضلع غربی کلیسا تعبیه شده است. تقریبا دو پنجم دیوارهای بنا سنگ چین و بخش فوقانی آن آجرچینی است. سنگ های استفاده شده در این بنا از نوع گرد هستند.
